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翌圣ZymeEditor™精品盘点之脱氧核糖核酸酶I(DNase I)

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2023-06-29T16:41 (访问量:6227)

翌圣ZymeEditor™精品盘点之脱氧核糖核酸酶I(DNase I)

脱氧核糖核酸酶I(Deoxyribonuclease I, DNase I),是一种可以消化单链或双链DNA的非特异性核酸内切酶。它能够水解磷酸二酯键,产生含有5'-磷酸基团和3'-OH基团的单脱氧核苷酸和寡脱氧核苷酸。

DNase I最佳的工作pH范围是7-8,其活性依赖于Ca2+,并可被二价金属离子如Mn2+,Mg2+,Zn2+等激活。在Mg2+存在条件下,DNase I 随机剪切双链DNA的任意位点;Mn2+存在条件下,DNase I可在同一位点剪切DNA双链,形成平末端,或1-2个核苷酸突出的粘末端。

 

图1. DNase I在Mg2+以及Mn2+存在下可切割dsDNA原理图

 

翌圣DNase I由ZymeEditor酶改造平台重组表达而来,无RNase残留,酶切效率高,作用底物类型广,可应用于体外转录去除模板DNA、RNA建库中去除rRNA、RNA提取或反转录前去除gDNA等多个场景。

 

 

产品特点

 

1、高酶切效率:37℃孵育可快速高效降解DNA;
2、无RNase残留
3、特异性强:特异性去除DNA,对RNA无影响;
4、底物多样性:可作用于单链DNA、双链DNA、染色质及DNA-RNA杂交链。

 

 

性能展示

 

 
 
 
1、无RNase残留
将DNase I与底物RNA孵育,琼脂糖凝胶电泳比较RNA谱带变化。结果显示翌圣DNase I无RNase残留。

 

图2. RNase残留检测 C:对照

 

 
 
 
2、高效去除模板DNA

分别使用翌圣及进口品牌T*、N*的DNase I进行体外转录中DNA模板去除,结果显示翌圣DNase I的模板DNA去除效率与国际进口品牌相当。

 

图3. 体外转录中模板DNA去除 C:不加DNase I对照;T*:进口品牌T*;N*:进口品牌N*;M:Marker

 

 
 
 
3、NGS建库,产量与进口品牌相当

分别使用翌圣及进口品牌T*的DNase I进行rRNA去除,将纯化后的RNA进行建库,结果显示翌圣与进口品牌的DNase I在进行rRNA去除后,RNA建库产量相当。

图4. DNase I用于RNA建库 T*:进口品牌T*

 

 

翌圣DNase I 选择指南

 

为满足不同的应用需求,翌圣可提供牛胰腺提取来源及大肠杆菌重组表达两种来源的DNase I,并可提供GMP级别DNase I,以满足mRNA体外转录等应用。

产品来源

产品定位

应用

产品名称

产品货号

牛胰腺提取

普通

主要用于从蛋白制备物中去除DNA

Deoxyribonuclease I (DNase I) from bovine pancreas

10607ES

10608ES

重组表达

RNase Free

适用于从RNA和蛋白制备物中去除DNA

Recombinant DNase I (RNase-free)

10325ES

重组表达

GMP级, RNase Free

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