①磷酸钙共沉淀法 用Ca2+沉淀磷酸离子和DNA，沉积在细胞质膜上的DNA可能通过吞噬作用被细胞吸收。
②DEAE-葡聚糖 它能结合DNA并促使细胞吸收。
③脂质体法 利用类脂经超声波、机械搅拌等处理，形成双脂层小囊泡，将DNA溶液包裹在内，通过与细胞质膜融合而使DNA进入细胞。
④脂质转染法 用人工合成的阳离子类脂与DNA形成复合性，借助类脂穿过质膜而将DNA导入细胞内。
⑤电穿孔法 在脉冲高压电场作用下将质膜瞬间击穿，DNA得以进入细胞，细胞膜随即修复正常。
⑥基因枪法 采用高速微弹发射装置，常用直径为1 μm左右的惰性重金属粉末作为微弹，如钨粉或金粉，其上沾有DNA，置于档板的凹穴内。当用火药或高压气体发射弹头撞击档板时，微弹即以极高的速度射向靶目标。
在以上诸方法中，磷酸钙共沉淀法成本低、操作方便，但效率低；脂质转染法和电穿孔法，前者需要昂贵的试剂，后者需要特殊的仪器，但效率高，现在较常用。对哺乳动物受精卵等较大的细胞，导入外源DNA可以用显微注射法，该方法效率极高，还可直接将DNA送入核内，但需要昂贵仪器，且技术复杂不易掌握。
除上述几种方法外，还可采用病毒介导的转染方法，更适用于较难转染的细胞，目前常用的有腺病毒、慢病毒及腺相关病毒（AAV），可根据以下3种病毒的特性选择合适的载体工具：