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Cell子刊解析非编码RNA在长寿中作用机制！

作者：上海云序生物科技有限公司 2018-11-05T17:26 (访问量:3391)

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众所周知，非编码RNA在多个领域中发挥重要的作用。而近期研究人员又发现，不同饮食习惯延长寿命的过程中，非编码RNA也会参与其中。今年3月21日，中国科学院韩敬东研究员在Cell Reports上在线发表了题为Impact of Dietary Interventions on Noncoding RNA Networks and mRNAs Encoding Chromatin-Related Factors 的研究论文，发现非编码RNA在长寿过程中发挥着重要作用。

Cell子刊解析非编码RNA在长寿中的作用机制！

人们已经发现，日常生活中，饮食习惯的改变能够大大影响人类对衰老相关疾病的易感度，甚至影响寿命。在不引起营养不良条件下的能量限制以及其他一些生活方式(比如自主锻炼)可以减少衰老相关疾病，比如肥胖、二型糖尿病和心血管疾病的发生。在不发生代偿性进食增加的情况下，能量限制可以延长多个物种的平均和最长寿命。然而，人们对于在长寿过程中转录组的改变机制知之甚少。

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方法

文章不同饮食习惯的小鼠的肝脏组织进行全转录组测序，得到了寿命相关的非编码RNA表达图谱。通过生物信息学分析，研究人员发现寿命相关的miRNA倾向于调控寿命正相关的蛋白编码基因。对miRNA靶基因进行GO分析，发现大部分基因与染色质功能相关。最后，对相关性最明显的基因Chd1进行机制探讨，通过敲除实验和ChIP测序实验，发现Chd1能够与基因的不同区域结合，调控基因的差异表达。

结果1
	通过全转录组测序，研究人员发现大部分的miRNA和lncRNA的表达水平与寿命是负相关的，对寿命相关miRNA进行分析，发现它倾向于调控寿命正相关的mRNA，并且这些寿命正相关的mRNA大多数都是染色质功能相关的基因。其中，染色质重塑因子Chd1与miR-34a的负相关性最明显。

结果2
	进一步探究Chd1作用机制时，研究人员将Chd1敲除后，寿命正相关的mRNA表达下调而寿命负相关的mRNA表达上调，另外，ChIP测序结果发现，Chd1与基因不同位置结合能发挥不同的作用。增强子或启动子区域的结合促进基因的表达，而远端区域的结合抑制基因的表达。
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