一、代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物（MW〈1000），主要是尿液、血浆或血清、唾液以及细胞和组织的提取液。

      二、代谢组学研究得到的最初结果一般为包含各种代谢物的谱峰。分析前需对谱峰进行预处理，包括背景扣除、滤噪、保留时间校正、谱峰匹配和归一化或标准化等。

      三、代谢组学主要是通过检测一系列样图，再结合化学模式识别方法（如主成等），利用PCA、t检验和方差分析等常用方法，判断生物体的病理生理状态、基能、药物的毒性和药效等，并有可能找到相关的生物标志物。

      四、代谢组学的主要分析技术方法：

1.核磁共振（NMR）：最常见的分析工具，能够实现对样品的非破坏性、非选择性分析，满足了代谢组学是的对尽可能多的化合物进行检测的目标。

2.气相色谱－质谱联用（GS－MS）：植物代谢组学研究中应用广泛，它的应用主要在于能够提供较高的分辨率和检测灵敏度，并且有可供参考的标准谱图库进行结果定性分析。

3.液相色谱－质谱联用（LS－MS）：以液相作为其分离方法，增强了其分辨能力，尤其是近来发展的超高压液相，可显著增强分析色谱的分辨率和灵敏度，与质谱联用不但可以获得差异代谢组信息，而且可以得到代谢组分的结构信息。