SWATH

产品定义

SWATH（Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragmentions）定量技术，将整个质谱扫描质量范围分为若干窗口，依次对每个窗口的所有离子进行碎裂，采集全部子离子信息。该技术无需指定目标肽段，扫描点数均匀，利用谱图库即可实现定性确证和定量离子筛选，同时可实现数据回溯。

实验流程

样品经胰酶酶切后，采用常规DDA质谱检测技术分析建立图谱库，之后采用SWATH方法进行质谱数据采集。定量数据采用Skyline，Peakview等软件处理。

使用仪器

TripleTOF 5600，TripleTOF 6600

技术优势

    1、灵敏度高：SWATH技术继承了MRM的数据采集模式，结合高分辨率的AB sciex Triple TOF-plus，具有与MRM相当的灵敏度；

　　2、可重现性高：重复样品间的定量相关性可达到0.99以上；

　　3、定量准确度高：定量准确度几乎与MRM技术相当；

　　4、线性动态范围广：定量范围可跨越4个数量级；

5、通量大：一次实验可检测到2000种以上蛋白并定量。

应用领域

疾病标志物筛选              作用机制研究

药物作用靶点研究           特殊功能蛋白质筛选

样品要求

蛋白提取物：≥500 μg

细胞：≥106

组织：动物组织≥10 mg,植物组织≥200 mg

体液：血清≥100μL，脑脊液≥200μL

可选择数据分析：

蛋白质/肽段鉴定及定量结果                      差异蛋白质统计分析

蛋白质GO分析及差异蛋白GO富集分析           蛋白质Pathway通路分析及差异蛋白的

Pathway通路分析                               

多样品间表达模式聚类分析（适用于样本数≥3的项目）

技术参考案例

1. Collins B C, Gillet L C, Rosenberger G, et al. Quantifying protein interaction dynamics by SWATH mass spectrometry: application to the 14-3-3 system[J]. Nature methods, 2013, 10(12): 1246-1253.